首先疼痛是早期肛瘺的一個(gè)主要的癥狀，瘺管通常無(wú)炎癥的時(shí)候，一般沒(méi)有疼痛，只有肛門的局部有一些腫脹感，行走的時(shí)候可能會(huì)加重，若外口已經(jīng)封閉，瘺管寄存了太多的糞便和一些膿液，然后這些物質(zhì)進(jìn)入瘺管之后就會(huì)引起疼痛的加重，或者是大便的時(shí)候疼痛劇烈。
第二，出現(xiàn)一些瘙癢的癥狀，這是因?yàn)楦亻T部的皮膚由于這些膿液，以及其他排出物的刺激，常常會(huì)造成皮膚瘙癢的癥狀，一般的比較嚴(yán)重可以形成一個(gè)肛周濕疹的癥狀。
第三，排膿是輕度肛瘺癥狀中主要的癥狀，一般來(lái)說(shuō)新瘺管排膿是比較多的，出現(xiàn)一些黃色粘液，如果是瘺管的時(shí)間比較長(zhǎng)的話，可能膿液時(shí)有時(shí)無(wú)，稀淡如水，如果膿量突然間增加了，這可能是又形成新的一個(gè)瘺管，瘺管有時(shí)會(huì)暫時(shí)的封閉，不排膿液，從而出現(xiàn)腫痛，體溫升高。
第四，會(huì)出現(xiàn)一些瘢痕，由于瘺管壁及瘺管的反復(fù)刺激致纖維組織增生，管壁和瘺口形成了一些結(jié)締組織等等。
