口腔內(nèi)存在大量的微生物，大多數(shù)是非致病的正常菌群，某些特異性的致病微生物才能引起牙周病，比較公認(rèn)的牙周病致病菌包括牙齦卟啉單胞菌、半放線桿菌等，這些致病菌在口腔內(nèi)并非隨機(jī)雜亂無(wú)章的排列，而是以牙菌斑的形式附著在牙齒表面，牙齒表面陰溝或者是牙周袋內(nèi)。
牙周牙菌斑是多種微生物按一定的比例一定的結(jié)構(gòu)粘附在一起，呈有機(jī)的生態(tài)群體，這種獨(dú)特的結(jié)構(gòu)可以使致病菌一定程度的抵抗人體的防御功能，對(duì)抗表面活性劑和抗生素的殺滅作用。
牙菌斑有一個(gè)形成、生長(zhǎng)、成熟、衰老的代謝過(guò)程，成熟階段和牙菌斑的致病作用最強(qiáng)，促進(jìn)牙周病進(jìn)展的因素，存在全身促進(jìn)因素，這些促進(jìn)因素不是牙周病發(fā)病的根本原因，但是它們能夠促進(jìn)牙周病的聚焦或削弱牙周組織的抵抗力，從而使牙周病得到進(jìn)展，包括牙石、軟垢、牙列擁擠、食物嵌塞、創(chuàng)傷性咬合、不良修復(fù)體和不良的正畸治療等。
