下丘腦分泌促生長激素釋放激素會促進以及調整垂體分泌生長激素，在進一步的促進生長激素的合成并且作用于靶器官，促進生長和代謝，這一個軸被稱為生長軸，下丘腦又接受高級中樞的神經傳入的信息而受到影響，下丘腦任何環(huán)節(jié)的障礙都有可能引起生長遲緩導致身材的矮小。
生長軸功能障礙的病因分類：
1、下丘腦垂體的先天異常是其中一個分類，位于中樞神經系統(tǒng)的發(fā)育異常引起下丘腦垂體的發(fā)育異常，會導致生長激素的缺乏，如全前腦缺乏或者說無腦、腦裂、發(fā)育不良、神經發(fā)育不良，面部的畸形比如單門齒腦中線發(fā)育不良，視神經伴透明膈發(fā)育不良等等。
2、破壞性的病變，比如顱底的骨折或者出血，其他損傷包括出生時候的缺血缺氧性的腦病，顱內腫瘤特別是神經膠質瘤，腦膜炎、顱內結核肉芽腫病，顱內血管瘤等等，對于顱腦、眼以及中耳不得放射治療，如果中樞神經系統(tǒng)惡性腫瘤以及白血病的治療時的頭顱治療，都有可能會影響到生長軸的激素的分泌。
另外是特發(fā)性的下丘腦垂體功能減低，多數(shù)病人下丘腦垂體功能減低未能發(fā)現(xiàn)明顯的病變，此類問題大多是下丘腦的病變所引起的。
